Размежевание в политике и идеологии между Приднестровьем и Молдовой повлекло за собой разделение систем образования. Возмущенная повсеместной румынизацией школы родительская общественность требовала перехода учреждений образования под юрисдикцию ПМР. Возглавило это движение Республиканское управление науки, народного образования, культуры и религии, образованное постановлением Верховного Совета ПМР 12 марта 1991 г. и реорганизованное в министерство 8 сентября 1992 г. Первым министром образования ПМР стала Л.Н. Ведерникова. Первоочередными задачами министерства являлись следующие:
- формирование образовательной сети республики, сохранение и развитие всех уровней образования – от дошкольного до послевузовского;
- обеспечение и защита конституционных прав граждан на получение образования на родном языке.
Уже 12 марта 1991 г. Верховным Советом ПМР принимается постановление «О первоочередных мерах по сохранению самобытности молдавского народа, его языка и культуры», а 19 февраля 1992 г. – «О мерах по обеспечению развития украинской национальной культуры и образования, удовлетворению социальных нужд украинского населения ПМР». В результате принятых мер фактически с первых лет существования республики получили государственную поддержку учреждения образования, ведущие учебный процесс на трех официальных языках – русском, молдавском и украинском, что было закреплено в сентябре 1992 г. законом «О языках в Приднестровской Молдавской Республике».

Однако не все педагогические коллективы, особенно молдавских школ в городах Тирасполь, Бендеры, Рыбница, Дубоссарском районе, одобрили борьбу за сохранение молдавского языка и образовательную политику ПМР. Проблема осложнялась нерешительностью, а в ряде районов и городов и сопротивлением со стороны руководителей местных управлений народного образования, не желавших выходить из подчинения Министерству образования Молдовы. Только вмешательство общественных организаций – ОСТК и Союза женщин Приднестровья, последовательная работа Верховного Совета и Правительства позволили сохранить общеобразовательную сеть республики.
Вместе с тем ситуация в системе образования ПМР оставалась достаточно напряженной. Объяснялось это острой нехваткой учебников, отсутствием финансовых средств на их издание и приобретение. В молдавских школах износ библиотечных фондов составлял в 1992 г. 80-90% в связи с изъятием из обращения в 1989 г. всех учебников на основе кириллической графики и их вывозом в Кишинев. Для выхода из создавшегося положения министерством формируются творческие группы педагогов-методистов и переводчиков в Тирасполе, Бендерах, Слободзейском, Григориопольском, Дубоссарском районах. В спешном порядке началась работа по созданию оригинальных учебников и переводу на молдавский язык учебников, изданных в России. В 1992 г. заключено 49 индивидуальных и коллективных договоров на подготовку учебников для молдавских школ. Однако работа шла медленно, так как у педагогов не было опыта подобной деятельности.
В 1996 г. издание учебной литературы стало системным, плановым, а в декабре 1998 г. Правительством утверждена государственная целевая программа «Учебник». В ней установлен порядок формирования и обеспечения стабильного функционирования единой системы приобретения, создания, издания и централизованного распределения учебной и учебно-методической литературы для учреждений общего образования республики. Были заключены прямые договоры с российскими издательствами «Просвещение», «Дрофа» и другими на поставку в ПМР новейшей учебной литературы. За полтора года (1999-2000 гг.) учреждения образования получили 180 тыс. учебников на сумму 150 тыс. дол. США. Параллельно создаются коллективы по переводу учебников на молдавский язык. Творческие группы работают над подготовкой учебников по молдавскому языку и литературе для школ с молдавским и русским языками обучения. Научными лабораториями Приднестровского госуниверситета им. Т.Г. Шевченко разрабатываются монографии и учебники по истории Молдавии и Приднестровья, географии и экономике родного края. Эта литература переводится на официальные языки ПМР и используется в учебном процессе школ и профессиональных учебных заведений.
Сегодня образование в Приднестровской Молдавской Республике провозглашается приоритетной сферой государственных интересов. Государство гарантирует общедоступность и бесплатность дошкольного, среднего общего, начального и среднего профессионального образования. Работающим гражданам предоставляется возможность получения второго и последующего начального, среднего и высшего профессионального образования. Основное общее образование обязательно.
Одной из острейших социальных проблем общества является воспитание и обеспечение детей с отклонениями в умственном и физическом развитии. Для них в республике сохранена развернутая сеть специальных образовательных учреждений. Это вспомогательные школы-интернаты в с. Глиное Слободзейского района, в городах Тирасполь, Дубоссары, Бендеры, школы-интернаты для глухих детей в Тирасполе, для слабослышащих – в Бендерах.
Создаются учреждения и для детей-инвалидов с поражением опорно-двигательного аппарата в Тирасполе и Рыбнице. Для детей с ослабленным зрением открыты дошкольные учреждения и школы в городах Тирасполь и Дубоссары.
Во всех районных центрах, крупных селах, городах активную деятельность ведут учреждения дополнительного образования – Дома детского и юношеского творчества; спортивные, музыкальные и художественные школы; станции юных техников, юных натуралистов, межшкольные учебно-производственные комбинаты. Они способствуют формированию мировоззрения ребенка, развитию его способностей и творческой индивидуальности.
По данным Министерства просвещения Приднестровской Молдавской Республики, в 2024–2025 учебном году в республике функционируют 158 организаций общего образования, в том числе 38 комплексов «Общеобразовательная школа — детский сад».
В Приднестровье функционируют 17 организаций среднего профессионального образования: 11 техникумов и 6 колледжей. Среди них «Промышленно-строительный техникум», г. Тирасполь, «Тираспольский техникум коммерции», «Тираспольский колледж бизнеса и сервиса», «Тираспольский аграрно-технический колледж им. М. В. Фрунзе», «Приднестровский колледж технологии и управления, «Тираспольский техникум информатики и права», «Тираспольский медицинский колледж им. Л. А. Тарасевича», «Бендерский педагогический колледж», «Бендерский торгово-технологический техникум», «Бендерский медицинский колледж», «Аграрно-экономический колледж, г. Бендеры, «Рыбницкий политехнический техникум», «Каменский политехнический техникум им. И. С. Солтыса» и др.
Крупнейшим образовательным и научно-исследовательским центром Приднестровской Молдавской Республики стал Приднестровский государственный университет им. Т.Г. Шевченко.
Это классический университет исследовательского типа с трехуровневой системой образования, главным вектором которого является учебно-воспитательная, научно-исследовательская и инновационная деятельность.
Вуз неоднократно успешно прошел аттестацию Федеральной службой по надзору в сфере образования и науки РФ, имеет свидетельство о государственной аккредитации образовательной деятельности и ориентирован на современные российские методы и технологии обучения.
Дипломы, выдаваемые выпускникам ПГУ, эквивалентны дипломам о высшем образовании Российской Федерации и признаются в странах, имеющих соответствующие соглашения с Россией.
Прекрасные традиции, фундаментальная наука, высокий уровень преподавания по праву сделали университет крупным научно-образовательным центром, известным не только в Приднестровской Молдавской Республике, но и далеко за её пределами.